โรงเรียนวัดฤๅษีสถิต ตั้งขึ้นเมื่อวันที่ ๓ สิงหาคม พ.ศ. ๒๔๘๑ เปิดทำการสอนชั้นประถมศึกษาปีที่ ๑ – ๔ เดิมใช้ศาลาวัดบ้านนาขามเป็นสถานที่เรียน ต่อมานักเรียนมีจำนวนเพิ่มขึ้น จึงย้ายไปเรียนที่ศาลาวัดฤๅษีสถิต และได้ย้ายมาในที่ปัจจุบัน เมื่อปี พ.ศ. ๒๕๐๐ มีพื้นที่ ๓๕ ไร่ ๑ งาน ๗๐ ตารางวา
ที่บ้านนาขาม เลขที่ ๘๘ หมู่ ๑๑ ตำบลดอนกอก อำเภอนาโพธิ์ จังหวัดบุรีรัมย์ เปิดทำการสอนตั้งแต่ระดับชั้นอนุบาล จนถึง มัธยมศึกษาปีที่ ๓
เนื่องจากอำเภอนาโพธิ์ เป็นอำเภอแห้งแล้ง ประกอบกับเมื่อวันที่ ๒๑ กรกฎาคม พ.ศ. ๒๕๓๐ พระบาทสมเด็จพระเจ้าอยู่หัว ทรงมีรับสั่งให้ศูนย์วิจัยและพัฒนาภูมิภาค สถาบันเทคโนโลยีแห่งเอเชีย ศึกษาหาข้อมูลพื้นที่ที่มีความแห้งแล้งที่สุดของประเทศไทย จากการศึกษาพบว่าพื้นที่อำเภอหนองสองห้อง จังหวัดขอนแก่น และ พื้นที่อำเภอนาโพธิ์ จังหวัดบุรีรัมย์ เป็นพื้นที่ที่มีความแห้งแล้งมากที่สุด และคุณภาพชีวิตประชาชนยังอยู่ในเกณฑ์ต่ำต่อมาในปี ๒๕๓๗ สมเด็จพระเทพรัตนราชสุดาฯสยามบรมรากุมารี
ทรงทราบถึงปัญหา และ รับสนองพระราชดำริ ของ พระบาทสมเด็จพระเจ้าอยู่หัวรับเอาพื้นที่ทั้งสองอำเภอ เข้าไว้ในโครงการส่วนพระองค์ทรงพระกรุณาโปรดเกล้าฯ ให้สำนักงานโครงการส่วนพระองค์ ร่วมกับส่วนราชการที่เกี่ยวข้อง ดำเนินโครงการพัฒนาคุณภาพชีวิตของประชาชนในพื้นที่ โดยคัดเลือกหมู่บ้านเป้าหมายนำร่อง
ในการพัฒนาคุณภาพชีวิตของประชาชน ๔ หมู่บ้าน คือ บ้านโนนตะคร้อ หมู่ที่ ๑๒ โรงเรียนวัดสระทอง บ้านโนนสะอาด หมู่ ๑๓ ตำบลบ้านคู บ้านหนองบัว หมู่ที่ ๙ บ้านโคกสะแทน หมู่ที่ ๑๐ ตำบลดอนกอก และ โรงเรียนวัดฤๅษีสถิต
ประวัติการเสด็จเยี่ยมโรงเรียน
ครั้งที่ 1 วันที่ 22 กุมภาพันธ์ 2542
ครั้งที่ 2 วันที่ 10 ธันวาคม 2544
วิสัยทัศน์ของโรงเรียน
สุขภาพดี มี คุณธรรม นำ วิชาการ สืบสานงานพระราชดำริ มีวิถึชีวิตอย่างพอเพียง
